Pura ini dibangun dengan arsitektur tradisional Bali yang ditandai oleh gerbang candi bentar, ukiran batu, serta pelinggih yang tertata rapi di dalam area pura. Letaknya yang dekat dengan laut memberikan nuansa sakral sekaligus menenangkan, terutama saat matahari terbit atau menjelang senja. Pengunjung yang datang untuk beribadah maupun sekadar melihat-lihat biasanya diminta menjaga sikap, berpakaian sopan, dan menghormati aturan setempat.

Selain menjadi tempat persembahyangan rutin bagi umat Hindu, Pura Jala Siddhi Amertha juga sering digunakan untuk upacara keagamaan tertentu, terutama yang berkaitan dengan laut sebagai sumber kehidupan. Pada waktu-waktu khusus, suasana pura menjadi lebih ramai dengan prosesi adat yang sarat makna spiritual dan budaya. Hal ini menjadikan pura bukan hanya bangunan religius, tetapi juga pusat pelestarian tradisi.

Lingkungan sekitar pura relatif bersih dan tertata, dengan akses yang cukup mudah bagi pengunjung. Dari beberapa sudut, pengunjung dapat menikmati pemandangan laut lepas yang menambah kesan damai selama berada di kawasan ini. Kombinasi antara nilai spiritual, keindahan alam, dan budaya menjadikan Pura Jala Siddhi Amertha menarik untuk dikunjungi oleh wisatawan yang ingin mengenal sisi religi Nusantara.